완도 다시마에서 신약 후보까지
OneBioBank는 완도 다시마(Saccharina japonica) 등 갈조류 유래 천연물에서 약물유사 후보 분자를 발굴하고, 단백질 타깃·질병 연관성을 거쳐 멘델리안 무작위화(MR)로 인과성을 검증하는 공개 연구 데이터 허브입니다.
다시마 연구 5단계 워크플로우
천연물(LOTUS · COCONUT) → 약물유사 분자(Lipinski 랭킹) → 단백질 타깃(Open Targets) → 질병 연관성(GWAS · FinnGen) → MR 인과추론(TwoSampleMR).
OneBioBank이란?
완도 다시마를 중심으로 한 갈조류 천연물의 신약 재창출(drug discovery)을 위한 엔드-투-엔드 데이터·분석 허브입니다. 천연물 데이터베이스, 유전체 GWAS 요약통계, 약물–타깃–질병 지식그래프(Open Targets)를 통합하고, 분석 파이프라인이 생성한 약물유사 후보 랭킹·타깃 연관·MR harmonized 입력을 함께 공개합니다.
데이터 출처 및 인용
다시마 후보 화합물 seaweed_druglike_ranked · QED 내림차순
LOTUS · COCONUT에서 추출한 갈조류 유래 후보 중 Lipinski 규칙을 통과한 약물유사 소분자입니다. 헤더를 클릭해 정렬하고, 검색창으로 필터링하세요. QED 열은 약물유사도(0–1)를 색으로 나타냅니다. 토글로 고분자(다당류) 버킷도 볼 수 있습니다.
타깃 탐색기 Open Targets Platform · 라이브 API
임의의 유전자 심볼을 검색해 연관 질병·연관성(datasource)·약물 작용기전(MoA)· 단백질 상호작용·조직 발현을 라이브로 조회합니다. 빠른 선택 칩으로 핵심 대사·염증 타깃을 바로 불러올 수 있고, 질병 검색으로 역방향(질병→타깃) 조회도 가능합니다.
질병 → 타깃 (역방향 조회)
MR 인과추론 Mendelian Randomization · harmonized 입력
노출–결과 쌍별 도구변수(instruments) 추출 및 대립유전자 정합(harmonization) 요약입니다. 각 쌍은 다시마 후보의 작용 가설과 연결됩니다.
방법론 노트
TwoSampleMR의 LD clumping → IVW/MR-Egger/Weighted median 분석에 바로 투입 가능한 형태입니다.
(대용량 40k행 TSV는 본 페이지에 임베드하지 않고 요약만 표시합니다.)
데이터 카탈로그 catalog/manifest.json
허브를 구성하는 모듈별 용량·파일 수·데이터 행 수 요약입니다.
데이터·쿼리 원본 다운로드 · 라이브 검색 · SQL 콘솔
허브 원본 데이터를 직접 탐색·다운로드하고, 라이브 API(DuckDB)로 화합물·타깃을 검색하거나 읽기전용 SQL을 실행할 수 있습니다.
원본 데이터 다운로드
전체 12.4 GB 원본 허브(GWAS · FinnGen · Open Targets · LOTUS · COCONUT
+ derived/ + catalog/)를 브라우저에서 탐색하고 내려받을 수 있습니다.
파일 브라우저는 읽기전용으로 제공됩니다.
라이브 검색 DuckDB API
데이터셋 서비스 전체 데이터셋 · 라이브 행 수
허브가 제공하는 모든 데이터셋과 실시간 행 수입니다. 미리보기로 각 데이터셋의 컬럼·샘플 행을 인라인으로 확인할 수 있습니다.
SQL 콘솔 읽기전용
읽기전용 SELECT / WITH … SELECT 쿼리만 허용되며, 허브 데이터에 한해
실행됩니다. 결과 행에는 상한(limit)이 적용됩니다.